В целях осуществления функций по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций, выполнения литерных полетов, аварийно-спасательных работ, оказания медицинской помощи и проведения санитарных и природоохранительных мероприятий Правительством Кыргызской Республики был принят Постановление №848 от 12 декабря 2002 года о создании Департамента авиации при Министерстве экологии и чрезвычайных ситуаций. 2009 году Департамент авиации был реорганизован в Государственное предприятие «Авиационное предприятие при Министерстве чрезвычайных ситуаций Кыргызской Республики».
